Ziraat Türkiye Kupası 5. Eleme Turu kura çekim töreni, TFF Hasan Doğan Milli Takımlar Kamp ve Eğitim Tesisleri Orhan Saka Konferans Salonu'nda gerçekleştirildi. Geçen yılın Kupa Şampiyonu Galatasaray-Tuzlaspor ile, Beşiktaş-Anagold 24 Erzincanspor ile Fenerbahçe-İstanbulspor ile, Trabzonspor ise Altay ile eşleşti.
Çift maç eleme usulüne göre oynanacak olan Ziraat Türkiye Kupası 5. Eleme Turu ilk maçları 3, 4 ve 5 Aralık 2019 tarihlerinde, rövanşları ise 17, 18 ve 19 Aralık 2019 tarihlerinde oynanacak.
Kura çekimi sonrası eşleşmeler şu şekilde oldu: